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英國Oxford Nanopore BASE Technology 第三代納米孔基因測序儀

價  格:詢價

產  地:英國更新時間:2020-09-29 16:34

品  牌:Oxford Nanopore型  號:Technology

狀  態:正常點擊量:1281

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Oxford Nanopore Technologies的Hagan Bayley及他的研究小組正致力于改善納米孔。根據他們之前的工作,他們以a-溶血素來設計納米孔,并將環式糊精共價結合在孔的內側(下圖)。當核酸外切酶消化單鏈DNA后,單個堿基落入孔中,它們瞬間與環式糊精相互作用,并阻礙了穿過孔中的電流。每個堿基ATGC以及甲基胞嘧啶都有自己特有的電流振幅,因此很容易轉化成DNA序列。每個堿基也有特有的平均停留時間,它的解離速率常數是電壓依賴的,+180 mV的電位能確保堿基從孔的另***側離開。

a-溶血素納米孔(剖面圖)以及共價結合的環式糊精(淺藍色)瞬間結合落入孔中的堿基(紅色)。

以往對甲基胞嘧啶進行測序,都要先進行重亞硫酸鹽轉化,而納米孔技術能直接讀出這第五種堿基。這對表觀基因組測序的研究人員來說可謂是個好消息。

納米孔測序預計能滿足大部分測序用戶的需求:99.8%的準確性相當高,且錯誤很容易通過計算來糾正。均聚物延伸也沒有問題,因為納米孔記錄每***個堿基,而不管其前后的堿基。讀長也會很長。Bayley認為:“它有可能讀取數千個堿基,序列質量也不會下降。即使中途有***些小差錯,它也可以重新開始。”

但是,Oxford Nanopore的測序儀仍面臨兩個重要的技術問題。***是如何將核酸外切酶更好地附著在孔上,讓它每次只掉入***個堿基,這是***個大挑戰。另***個是并行化。這個問題可能簡單***些。他們可以開發出***個芯片,上面有數萬個孔,來確保整個測序過程更快速。

在納米孔測序技術的推動下,實現千元基因組的目標指日可待了。


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